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在多个条件下对R中的数据框进行子集化: 我想通过告诉R什么不保留在新的数据框中来对数据框进行分类。这是一个简单的示例数据框： data v1 v2 v3 v4 avdc avdd bnpg bddhckdccrpg dvdx dvdc evdb evdc 如果列v1有一个“b”，“d”或“e”，我想摆脱那行观察，产生下面的dataframe： v1 v2 v3 v4 avdc avdd ckdccrpg 我已经成功地一次性用掉了一个 sub.data<-data[data[,1] != "b",] 但是我想要摆脱的东西有很多，所以一次只做一件是不可取的。我没有成功与以下几点： sub.data<-data[data[,1] != c("b","d","e") 要么 sub.data<-subset(data, data[,1] != c("b","d","e")) 我也尝试了一些其他的东西，比如!%in% ，但似乎并不存在。有任何想法吗？

任何使散点图中的绘图点在R中更透明的方法？: 我有一个3列matrix; 根据第1列和第2列值绘制点图，但是根据第2列（6个不同组）绘制颜色。我可以成功地绘制所有的点，但是最后一个被分配了紫色的绘图组（组6）掩盖了其他组的绘图。有没有办法让情节点更透明？ s <- read.table("/…/parse-output.txt", sep="\t") dim(s) [1] 67124 3 x <- s[,1] y <- s[,2] z <- s[,3] cols <- cut(z, 6, labels = c("pink", "red", "yellow", "blue", "green", "purple")) plot(x, y, main= "Fragment recruitment plot – FR-HIT", ylab = "Percent identity", xlab = "Base pair position", col = as.character(cols), pch=16)

按名称重命名多个列: 有人应该问这个，但我找不到答案。说我有： x = data.frame(q=1,w=2,e=3, …and many many columns…) 什么是最优雅的方式来重新命名一个任意的列的子集，其位置，我不一定知道，到一些其他的任意名称？例如说我想将"q"和"e"重命名为"A"和"B" ，那么最优雅的代码是什么？显然，我可以做一个循环： oldnames = c("q","e") newnames = c("A","B") for(i in 1:2) names(x)[names(x) == oldnames[i]] = newnames[i] 但是我想知道有没有更好的办法？也许使用一些软件包？（ plyr::rename等）

错误：刚刚无法加载已安装的软件包: 当我试图在Eclipse中运行R控制台时，出现此错误： ….Please make sure that R package 'rj' (1.1 or compatible) is installed… 所以我试图把它安装在R控制台中，像这样： install.packages(c("rj", "rj.gd"), repos="http://download.walware.de/rj-1.1") 并得到这个错误： ** testing if installed package can be loaded Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rj.gd', details: call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, …) error: unable to load shared object '/home/alex/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/rj.gd/libs/rj.gd.so': libjvm.so: cannot open shared object file: No […]

在R上传超过2.15 GB的文件: 我有一个手动过程，我正在上传5-6 GB的文件通过curl的Web服务器： curl -X POST –data-binary @myfile.csv http://myserver::port/path/to/api 这个过程工作正常，但我很想使用R自动化它。问题是，我要么不知道我在做什么，或者curl的R库不知道如何处理大于2GB的文件： library(RCurl) postForm( "http://myserver::port/path/to/api", file = fileUpload( filename = path.expand("myfile.csv"), contentType = "text/csv" ),.encoding="utf-8") Yeilds Error: Internal Server Error httr也不起作用： library(httr) POST( url = "http://myserver:port/path/to/api", body = upload_file( path = path.expand("myfile.csv"), type = 'text/csv'), verbose() ) 这产生： Response [http://myserver:port/path/to/api] Date: 2015-06-30 11:11 Status: 400 Content-Type: <unknown> <EMPTY […]

代码折叠在书上: RMarkdown中的代码折叠选项是非常棒的。该选项使程序化方法对于感兴趣的人是透明的，而不会迫使观众翻阅数英里的代码。通过散文和交互式graphics输出，代码的紧密放置使得整个项目更容易被更广泛的读者所接受，而且还减less了对额外文档的需求。对于一个更大的项目，我正在使用bookdown，而且效果很好。唯一的问题是没有代码折叠选项。代码折叠当前未在bookdown中启用。（请参阅在bookdown中启用代码折叠）我知道我不需要一个select来实现它。我只需要把正确的代码粘贴在正确的地方或地方。但是什么代码和哪里？一个可行的替代方法是将代码块放置在页面中块的输出之下。或者，最后把它们作为附录。我可以做到这一点，但不能像rbookdown重现。

在S4中的对象，方法和编程的来源: 由于我经常遇到需要进行S4编程的情况，所以我已经收集了很多关于S4对象，方法和编程的资料。我把它们列在这里作为参考。请添加您自己的来源。在网上这些methods帮助文件：来自包方法的帮助文件，其中可以find许多必要的信息在15页的S4类：简短介绍与S4对象的编程。 S4方法是如何工作的：更多关于底层机制的解释。对S4的简短介绍：用实际的例子来说明如何构build类和一些有用的技巧。它包含一个方便的概述作为附录，但也包含错误。应该小心使用这一个。 R中的面向对象：S3和S4上的实例 S4对象：Thomas Lumley关于S4对象的介绍。 R面向对象编程：深入介绍R中面向对象编程。它涵盖了S3，S4和S4参考类。随附的序列包实现了整个幻灯片中使用的类系统。图书数据分析软件 – 与R编程（J.Chambers）：一个经典的，虽然没有审查积极的地方，其中包含了一个关于S4 R编程生物信息学（R. Gentleman）：专门针对与完全基于S4的Bioconductor合作。但它提供了一个广泛的概述，也是很多其他人有用的。 PS：如果有人find社区checkbox，可以将其设为社区拥有的post。不知何故，我无法再在编辑窗口中find它…

有没有办法从JavaScript运行R代码？: 我正在开发一个项目，需要运行一些R代码来进行一些数据分析。该项目主要是在JavaScript中，我需要一种方法来从JS运行R代码。我的研究还没有find任何好办法呢。有没有办法做到这一点？另外，我还没有R的经验（另一个人提供R代码）。

R中的read.csv（）和read.csv2（）之间的区别: 在R中，read.csv（）和read.csv2（）有什么区别官方文件说，在各种欧洲语言环境中，由于逗号字符用作小数点，因此应该使用read.csv2函数这是什么意思。我没有看到任何表面上的差异。谁能给出一个具体的例子来进一步澄清呢？