错误：刚刚无法加载已安装的软件包
当我试图在Eclipse中运行R控制台时，出现此错误：
....Please make sure that R package 'rj' (1.1 or compatible) is installed... 所以我试图把它安装在R控制台中，像这样：
install.packages(c("rj", "rj.gd"), repos="http://download.walware.de/rj-1.1")
并得到这个错误：
** testing if installed package can be loaded Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rj.gd', details: call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) error: unable to load shared object '/home/alex/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/rj.gd/libs/rj.gd.so': libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory Error: loading failed Execution halted ERROR: loading failed
我发现在安装rJava时使用： install.packages("rJava")会得到一个类似的错误：
** testing if installed package can be loaded Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details: call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) error: unable to load shared object '/home/alex/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/rJava/libs/rJava.so': libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory Error: loading failed Execution halted ERROR: loading failed
当我运行sudo R CMD javareconf ，我得到了这个输出：
Java interpreter : /usr/bin/java Java version : 1.7.0 Java home path : /usr/lib/jvm/java-7-oracle/jre Java compiler : /usr/bin/javac Java headers gen.: /usr/bin/javah Java archive tool: /usr/bin/jar NOTE: Your JVM has a bogus java.library.path system property! Trying a heuristic via sun.boot.library.path to find jvm library... Java library path: $(JAVA_HOME)/lib/amd64:$(JAVA_HOME)/lib/amd64/server JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/amd64 -L$(JAVA_HOME)/lib/amd64/server -ljvm JNI cpp flags : -I$(JAVA_HOME)/../include -I$(JAVA_HOME)/../include/linux Updating Java configuration in /etc/R Done.
顺便说一句，我的configuration是：
Ubuntu 11.10 64bit Eclipse 3.7 Oracle-1.7-jdk R version 2.15.1
对于Linux（Ubuntu）用户：如果您安装了oracle-java（7/8） 。 它将位于/usr/lib/jvm这个位置，并且需要sudo访问。
使用以下条目创build文件/etc/ld.so.conf.d/java.conf ：
/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64 /usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server
（用java-7-oraclereplacejava-8-oracle，取决于你的java版本）
然后：
sudo ldconfig
重新启动RStudio，然后安装rJava软件包。
要么
还有一种替代方法是使用从命令R CMD javareconf -e获得的Java库path的值导出LD_LIBRARY_PATH ，然后运行install.packages
我得到了类似的问题，并能够通过运行来解决它
R CMD javareconf -e
R CMD javareconf -e的输出
Java interpreter : /export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/jre/bin/java Java version : 1.6.0_27 Java home path : /export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27 Java compiler : /export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/bin/javac Java headers gen.: /export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/bin/javah Java archive tool: /export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/bin/jar Java library path: /export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/jre/lib/amd64/server:/export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/jre/lib/amd64:/export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/jre/../lib/amd64:/usr/java/packages/lib/amd64:/usr/lib64:/lib64:/lib:/usr/lib JNI linker flags : -L/export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/jre/lib/amd64/server -L/export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/jre/lib/amd64 -L/export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/jre/../lib/amd64 -L/usr/java/packages/lib/amd64 -L/usr/lib64 -L/lib64 -L/lib -L/usr/lib -ljvm JNI cpp flags : -I/export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/include -I/export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/include/linux The following Java variables have been exported: JAVA_HOME JAVA JAVAC JAVAH JAR JAVA_LIBS JAVA_CPPFLAGS JAVA_LD_LIBRARY_PATH Running: /bin/bash
在将LD_LIBRARY_PATH设置为与JAVA_LD_LIBRARY_PATH相同的值之后，如上面的输出中所示。 我能够安装rj。
export LD_LIBRARY_PATH=/export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/jre/lib/amd64/server:/export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/jre/lib/amd64:/export/apps/jdk/JDK-1_6_0_27/jre/../lib/amd64:/usr/java/packages/lib/amd64:/usr/lib64:/lib64:/lib:/usr/lib
运行R，然后安装rj
install.packages(c("rj", "rj.gd"), repos="http://download.walware.de/rj-1.1")
我find了解决办法：
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-7-oracle/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java-7-oracle/jre/lib/amd64/server
然后
sudo R CMD javareconf
我做了以下，它为我工作：
export LD_LIBRARY_PATH=$JAVA_LD_LIBRARY_PATH sudo R CMD javareconf
那么我也必须重新启动R。
多年以后，我在searchR报告的错误之后，在没有成功安装一个需要转移到Oracle的Java的软件包之后，我终于遇到了这个问题。
我只需要做的就是解决这个问题：
$ sudo R CMD javareconf
或者只是在R中设置库？
我只是在R中运行这个命令：
Sys.setenv(JAVA_HOME='/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server')
（用你的Java库pathreplace“/ usr / lib / jvm / java-7 -openjdk-amd64 / jre / lib / amd64 / server”，运行“sudo R CMD javareconf”）
可能不是最优雅的解决scheme – 但它对我来说是有效的！
当limjvm.so缺lesslimjvm.so错误时，请确保从/etc/R的标准configuration中获取正确的ldpaths而不是/usr/lib/R/etc的标准configuration。
这为我解决了LD_LIBRARY_PATH问题（Linux，Debian 7.1.0，tc-shell，R版本3.0.2）：
将此行添加到.cshrc：
setenv LD_LIBRARY_PATH $ JAVA_HOME / jre / lib / amd64：$ JAVA_HOME / jre / lib / amd64 / server
将此命令添加到〜/ .login是不够的; 在新的xterms中，环境variablesLD_LIBRARY_PATH仍然是未知的：echo $ LD_LIBRARY_PATH：LD_LIBRARY_PATH：未定义的variables。 （为什么？？）
奇怪的是，当以超级用户身份启动R时，findlibjvm.so没有任何问题。
我没有安装jdk，我可以用sudo apt-get install jdk-*之后，我可以运行sudo R CMD javareconf ，它总是在之前引发错误信息。 一切都设置正确，没有手动的镊子，并在软件包安装后在R运行平稳（需要重新启动）。
我通过用sudo运行R来解决这个问题，然后运行install.packages('rJava`) 。
以上都没有为我工作，在Linux Ubuntu上安装rJava没有任何问题的唯一解决scheme是安装基础R后通过RScript命令：
$ sudo Rscript -e 'install.packages("rJava", repos = "http://cran.r-project.org/")'
