Python – 一个字典慢find每个字符的频率?
我试图使用O(n)复杂度的algorithm在任何给定的文本中find每个符号的频率。 我的algorithm如下所示:
s = len(text) P = 1.0/s freqs = {} for char in text: try: freqs[char]+=P except: freqs[char]=P
但是我怀疑这个字典方法是否足够快,因为它取决于字典方法的底层实现。 这是最快的方法吗?
更新:如果使用集合和整数,速度没有增加。 这是因为该algorithm已经具有O(n)复杂性,所以没有必要的加速可能。
例如,1MB文本的结果:
without collections: real 0m0.695s with collections: real 0m0.625s
性能比较
注意:表中的时间不包括加载文件所需的时间。
| approach | american-english, | big.txt, | time wrt defaultdict | | | time, seconds | time, seconds | | |----------------+-------------------+---------------+-------------------------| | Counter | 0.451 | 3.367 | 3.6 | | setdefault | 0.348 | 2.320 | 2.5 | | list | 0.277 | 1.822 | 2 | | try/except | 0.158 | 1.068 | 1.2 | | defaultdict | 0.141 | 0.925 | 1 | | numpy | 0.012 | 0.076 | 0.082 | | S.Mark's ext. | 0.003 | 0.019 | 0.021 | | ext. in Cython | 0.001 | 0.008 | 0.0086 | #+TBLFM: $4=$3/@7$3;%.2g
使用的文件: '/usr/share/dict/american-english'
和'big.txt'
。
比较'Counter','setdefault','list','try / except','defaultdict','numpy','cython'和@ S.Mark的解决scheme的脚本在http:// gist。 github.com/347000
最快的解决scheme是用Cython编写的Python扩展:
import cython @cython.locals( chars=unicode, i=cython.Py_ssize_t, L=cython.Py_ssize_t[0x10000]) def countchars_cython(chars): for i in range(0x10000): # unicode code points > 0xffff are not supported L[i] = 0 for c in chars: L[c] += 1 return {unichr(i): L[i] for i in range(0x10000) if L[i]}
以前的比较:
* python (dict) : 0.5 seconds * python (list) : 0.5 (ascii) (0.2 if read whole file in memory) * perl : 0.5 * python (numpy): 0.07 * c++ : 0.05 * c : 0.008 (ascii)
input数据:
$ tail /usr/share/dict/american-english éclat's élan élan's émigré émigrés épée épées étude étude's études $ du -h /usr/share/dict/american-english 912K /usr/share/dict/american-english
python(Counter):0.5秒
#!/usr/bin/env python3.1 import collections, fileinput, textwrap chars = (ch for word in fileinput.input() for ch in word.rstrip()) # faster (0.4s) but less flexible: chars = open(filename).read() print(textwrap.fill(str(collections.Counter(chars)), width=79))
运行:
$ time -p python3.1 count_char.py /usr/share/dict/american-english
Counter({'e':87823,'':86620,'i':66548,'a':62778,'n':56696,'r': 56286,'t':51588,'o':48425,'1':39914,'c':30020,'d':28068,'u':25810, “'”:24511,'g':22262,'p':20917,'m':20747,'h':18453,'b':14137,'y': 12367,f:10049,k:7800,v:7573,w:6924,z:3088,x:2082,M: 1686“C”1549“S”1515“q”1447“B”1387“j”1376“A”1345“P” 974,“L”:912,“H”:860,“T”:858,“G”:811,“D”:809,“R”:749,“K”:656,“E” 618,'J':539,'N':531,'W':507,'F':502,'O':354,'I':344,'V':330,'Z' 150,Y,140,128,U,117,Q,63,X,42, 'ó':10,'á':10,'ä':7,'ê':6,''6,'':6,'ç':4,'å':3,' ':3,'í': 2,'ô':2,'Å':1}) 真正的0.44 用户0.43 sys 0.01
perl:0.5秒
time -p perl -MData::Dumper -F'' -lanwe'$c{$_}++ for (@F); END{ $Data::Dumper::Terse = 1; $Data::Dumper::Indent = 0; print Dumper(\%c) } ' /usr/share/dict/american-english
输出:
''=> 1515,'K'=> 656,'=> 29,'d'=> 28068,'Y'=> 140,'E'=> 618,'y'=> 12367' g'=> 22262,'e'=> 87823,'=> 2,'J'=> 539,'=> 241,'=> 3,'=> 6,'=> 4, '=> 128,'D'=> 809,'q'=> 1447,'b'=> 14137,'z'=> 3088,'w'=> 6924,'Q'=> > 10,'M'=> 1686,'C'=> 1549,'=> 10,'L'=> 912,'X'=> 42,'P'=> 974, ''=> 24511,'=> 6,'a'=> 62778,'T'=> 858,'N'=> 531,'j'=> 1376,'Z'=> 'u'=> 25810,'k'=> 7800,'t'=> 51588,'=> 6,'W'=> 507,'v'=> 7573,'s'=> 86620' '=> 1387,'H'=> 860,'c'=> 30020,'=> 12,'I'=> 344,'=> 3,'G'=> 811,'U'=> 117',F'=> 502,'=> 2,'r'=> 56286,'x'=> 2082,'V'=> 330,'h'=> 18453,'f'=> '=> 1,'i'=> 66548,'A'=> 1345,'0'=> 354,'n'=> 56696,'m'=> 20747,'1'=> 39914' => 7,'p'=> 20917,'R'=> 749,'o'=> 48425} 真正的0.51 用户0.49 sys 0.02
python(numpy):0.07秒
基于antAasma的答案 (修改为支持unicode):
#!/usr/bin/env python import codecs, itertools, operator, sys import numpy filename = sys.argv[1] if len(sys.argv)>1 else '/usr/share/dict/american-english' # ucs2 or ucs4 python? dtype = {2: numpy.uint16, 4: numpy.uint32}[len(buffer(u"u"))] # count ordinals text = codecs.open(filename, encoding='utf-8').read() a = numpy.frombuffer(text, dtype=dtype) counts = numpy.bincount(a) # pretty print counts = [(unichr(i), v) for i, v in enumerate(counts) if v] counts.sort(key=operator.itemgetter(1)) print ' '.join('("%s" %d)' % c for c in counts if c[0] not in ' \t\n')
输出:
("Å" 1) ("í" 2) ("ô" 2) ("å" 3) ("û" 3) ("ç" 4) ("â" 6) ("ê" 6) ("ñ" 6) ("ä" 7) ("á" 10) ("ó" 10) ("ö" 12) ("ü" 12) ("è" 29) ("X" 42) ("Q" 63) ("U" 117) ("é" 128) ("Y" 140) ("Z" 150) ("V" 330) ("I" 344) ("O" 354) ("F" 502) ("W" 507) ("N" 531) ("J" 539) ("E" 618) ("K" 656) ("R" 749) ("D" 809) ("G" 811) ("T" 858) ("H" 860) ("L" 912) ("P" 974) ("A" 1345) ("j" 1376) ("B" 1387) ("q" 1447) ("S" 1515) ("C" 1549) ("M" 1686) ("x" 2082) ("z" 3088) ("w" 6924) ("v" 7573) ("k" 7800) ("f" 10049) ("y" 12367) ("b" 14137) ("h" 18453) ("m" 20747) ("p" 20917) ("g" 22262) ("'" 24511) ("u" 25810) ("d" 28068) ("c" 30020) ("l" 39914) ("o" 48425) ("t" 51588) ("r" 56286) ("n" 56696) ("a" 62778) ("i" 66548) ("s" 86620) ("e" 87823) real 0.07 user 0.06 sys 0.01
c ++:0.05秒
// $ g++ *.cc -lboost_program_options // $ ./a.out /usr/share/dict/american-english #include <iostream> #include <fstream> #include <cstdlib> // exit #include <boost/program_options/detail/utf8_codecvt_facet.hpp> #include <boost/tr1/unordered_map.hpp> #include <boost/foreach.hpp> int main(int argc, char* argv[]) { using namespace std; // open input file if (argc != 2) { cerr << "Usage: " << argv[0] << " <filename>\n"; exit(2); } wifstream f(argv[argc-1]); // assume the file has utf-8 encoding locale utf8_locale(locale(""), new boost::program_options::detail::utf8_codecvt_facet); f.imbue(utf8_locale); // count characters frequencies typedef std::tr1::unordered_map<wchar_t, size_t> hashtable_t; hashtable_t counts; for (wchar_t ch; f >> ch; ) counts[ch]++; // print result wofstream of("output.utf8"); of.imbue(utf8_locale); BOOST_FOREACH(hashtable_t::value_type i, counts) of << "(" << i.first << " " << i.second << ") "; of << endl; }
结果:
$ cat output.utf8
(í2)(O 354)(P 974)(Q 63)(R 749)(S 1,515)(ñ6)(T 858)(U 117)(ó10)(ô2)(V 330)(W 507)(X 42)(ö12)(Y 140)(Z 150)(û3)(ü12)(a 62,778)(b 14,137)(c 30,020)(d 28,068)(e 87,823)(f 10,049) (g 22,262)(h 18,453)(i 66,548)(j 1,376)(k 7,800)(l 39,914)(m 20,747)(n 56,696)(o 48,425)(p 20,917)(q 1,447)(r 56,286)(s 86,520)(t 51,588)(u 25,810)(Å1)('24,511)(v 7,573)(w 6,924)(x 2,082)(y 12,367)(z 3,088)(A 1,345)(B 1,387)(C 1,549) (10)(6)(D 809)(E 618)(F 502)(ä7)(å3)(G 811)(H 860)(ç4)(I 344)(J 539)(è 29)(K 656)(128)(ê6)(L 912)(M 1,686)(N 531)
c(ascii):0.0079秒
// $ gcc -O3 cc_ascii.c -o cc_ascii && time -p ./cc_ascii < input.txt #include <stdio.h> enum { N = 256 }; size_t counts[N]; int main(void) { // count characters int ch = -1; while((ch = getchar()) != EOF) ++counts[ch]; // print result size_t i = 0; for (; i < N; ++i) if (counts[i]) printf("('%c' %zu) ", (int)i, counts[i]); return 0; }
如何避免循环内的浮动操作,并做完所有事情之后呢?
通过这种方式,你可以每次做+1,而且应该更快。
最好像S.Lott所build议的那样使用collections.defaultdict。
freqs=collections.defaultdict(int) for char in text: freqs[char]+=1
或者您可能想尝试,在Python 2.7以上的collections.Counter
>>> collections.Counter("xyzabcxyz") Counter({'y': 2, 'x': 2, 'z': 2, 'a': 1, 'c': 1, 'b': 1})
要么
你可以试试psyco ,它可以及时编译python。 你有循环,所以我认为你会得到一些与psyco性能增益
编辑1:
我做了一些基于big.txt ( 〜6.5 MB)的基准,这是用于拼写校正器 peter norvig
Text Length: 6488666 dict.get : 11.9060001373 s 93 chars {u' ': 1036511, u'$': 110, u'(': 1748, u',': 77675, u'0': 3064, u'4': 2417, u'8': 2527, u'<': 2, u'@': 8, .... if char in dict : 9.71799993515 s 93 chars {u' ': 1036511, u'$': 110, u'(': 1748, u',': 77675, u'0': 3064, u'4': 2417, u'8': 2527, u'<': 2, u'@': 8, .... dict try/catch : 7.35899996758 s 93 chars {u' ': 1036511, u'$': 110, u'(': 1748, u',': 77675, u'0': 3064, u'4': 2417, u'8': 2527, u'<': 2, u'@': 8, .... collections.default : 7.29699993134 s 93 chars defaultdict(<type 'int'>, {u' ': 1036511, u'$': 110, u'(': 1748, u',': 77675, u'0': 3064, u'4': 2417, u'8': 2527, u'<': 2, u'@': 8, ....
CPU规格:1.6GHz的英特尔移动primefacesCPU
据此, dict.get
最慢 , collections.defaultdict
最快, try/except
也是最快的之一。
编辑2:
添加collections.Counter
基准,它比dict.get
慢,并在我的笔记本电脑中花了15s
collections.Counter : 15.3439998627 s 93 chars Counter({u' ': 1036511, u'e': 628234, u't': 444459, u'a': 395872, u'o': 382683, u'n': 362397, u'i': 348464,
我写了Char Counter C扩展到Python,看起来比collections.Counter
快300 倍.Counter和150倍于collections.default(int)
C Char Counter : 0.0469999313354 s 93 chars {u' ': 1036511, u'$': 110, u'(': 1748, u',': 77675, u'0': 3064, u'4': 2417, u'8': 2527, u'<': 2, u'@': 8,
这是Char Counter C扩展代码
static PyObject * CharCounter(PyObject *self, PyObject *args, PyObject *keywds) { wchar_t *t1;unsigned l1=0; if (!PyArg_ParseTuple(args,"u#",&t1,&l1)) return NULL; PyObject *resultList,*itemTuple; for(unsigned i=0;i<=0xffff;i++)char_counter[i]=0; unsigned chlen=0; for(unsigned i=0;i<l1;i++){ if(char_counter[t1[i]]==0)char_list[chlen++]=t1[i]; char_counter[t1[i]]++; } resultList = PyList_New(0); for(unsigned i=0;i<chlen;i++){ itemTuple = PyTuple_New(2); PyTuple_SetItem(itemTuple, 0,PyUnicode_FromWideChar(&char_list[i],1)); PyTuple_SetItem(itemTuple, 1,PyInt_FromLong(char_counter[char_list[i]])); PyList_Append(resultList, itemTuple); Py_DECREF(itemTuple); }; return resultList; }
char_counter和char_list在模块级别是malloc-ated,所以每次调用函数时都不需要malloc。
char_counter=(unsigned*)malloc(sizeof(unsigned)*0x10000); char_list=(wchar_t*)malloc(sizeof(wchar_t)*0x10000);
它返回一个带有元组的列表
[(u'T', 16282), (u'h', 287323), (u'e', 628234), (u' ', 1036511), (u'P', 8946), (u'r', 303977), (u'o', 382683), ...
要转换为字典格式,只需要dict()
就可以了。
dict(CharCounter(text))
PS:基准包括时间转换为字典
CharCounter
只接受Python Unicodestringu""
,如果文本是utf8,需要提前执行.decode("utf8")
。
input支持Unicode直到基本多语言平面(BMP) – 0x0000到0xFFFF
不,它不是最快的,因为你知道人物的范围是有限的,你可以使用列表和直接索引,使用字符的数字表示来存储频率。
打dict
是非常非常困难的。 这是非常高度的调整,因为几乎所有的Python是基于字典。
我不熟悉python,但是为了find频率,除非你知道频率范围(在这种情况下你可以使用一个数组),字典是要走的路。
如果你知道你的字符在一个Unicode,ASCII等范围内,你可以定义一个数组正确的数值。
然而,这将把这个从O(n)到O(可能n)的空间复杂度改变,但是你将获得从O(n *(字典提取/插入时间))到O(n)的时间复杂度提高。
如果你真的关心速度,你可能会首先考虑整数字符,然后通过(浮点)除法来获得频率。
这里是数字:
python -mtimeit -s'x=0' 'x+=1' 10000000 loops, best of 3: 0.0661 usec per loop python -mtimeit -s'x=0.' 'x+=1.' 10000000 loops, best of 3: 0.0965 usec per loop
好吧,你可以用老式的方式来做…因为我们知道没有太多的不同的字符,它们是连续的,我们可以使用一个普通的数组(或列表),并使用字符顺序编号进行索引:
s = 1.0*len(text) counts = [0]*256 # change this if working with unicode for char in text: freqs[ord(char)]+=1 freqs = dict((chr(i), v/s) for i,v in enumerate(counts) if v)
这可能会更快,但只是一个恒定的因素,这两种方法应该有相同的复杂性。
在“爱丽丝梦游仙境”(163793个字符)和古登堡计划的“圣经,杜伊 – 兰斯版本”(5649295个字符)
from collections import defaultdict import timeit def countchars(): f = open('8300-8.txt', 'rb') #f = open('11.txt') s = f.read() f.close() charDict = defaultdict(int) for aChar in s: charDict[aChar] += 1 if __name__ == '__main__': tm = timeit.Timer('countchars()', 'from countchars import countchars') print tm.timeit(10)
我得到:
2.27324003315 #Alice in Wonderland 74.8686217403 #Bible
这两本书的字符数之比为0.029
,时间比为0.030
,因此algorithm是O(n),其常数因子很小。 对于大多数(全部)目的来说足够快,我应该想一想。
如果数据是单字节编码,则可以使用numpy来加速计数过程:
import numpy as np def char_freq(data): counts = np.bincount(np.frombuffer(data, dtype=np.byte)) freqs = counts.astype(np.double) / len(data) return dict((chr(idx), freq) for idx, freq in enumerate(freqs) if freq > 0)
一些快速的基准testing显示,这比汇总到defaultdict(int)大约快10倍。
为了避免尝试开销,可以使用defaultdict。
小的加速将是dict.setdefault
方法的使用,这样你不会为每个新遇到的字符支付相当大的代价:
for char in text: freq[char] = freq.setdefault(char, 0.0) + P
作为一个旁注: except:
裸露被认为是非常糟糕的做法。