调用系统后makePSOCKcluster挂在win x64上
在Windows上，R x64上的parallel包中makePSOCKcluster难以debugging的问题。 它不会在Windows上的R i386上，也不在任何OSX或Linux上发生。 不幸的是，这种情况并不总是一致地发生，只是偶尔和非常随机的。
会发生什么是makePSOCKcluster函数超时并冻结R会话，但是只有在会话的前面执行一些（任意） system()调用时才会发生。 下面的video和脚本更清楚地说明了这个问题。
有些东西我尝试没有成功：
- 禁用防病毒/防火墙。
- 等待调用
system和makePSOCKcluser之间的几秒钟。 - 使用不同的系统调用。
我将如何进一步缩小这个范围？ 这里video和video中使用的脚本是：
cmd_exists <- function(command){ iswin <- identical(.Platform$OS.type, "windows"); if(iswin){ test <- suppressWarnings(try(system(command, intern=TRUE, ignore.stdout=TRUE, ignore.stderr=TRUE, show.output.on.console=FALSE), silent=TRUE)); } else { test <- suppressWarnings(try(system(command, intern=TRUE, ignore.stdout=TRUE, ignore.stderr=TRUE), silent=TRUE)); } !is(test, "try-error") } options(hasgit = cmd_exists("git --version")); options(haspandoc = cmd_exists("pandoc --version")); options(hastex = cmd_exists("texi2dvi --version")); cluster <- parallel::makePSOCKcluster(1);
在创build所谓的worker进程时， makePSOCKCluster或更一般的makeCluster可以挂起，原因有很多，其中包括使用Rscript命令启动新的R会话，该命令将执行.slaveRSOCK函数，该函数将创build一个套接字连接回到掌握，然后执行slaveLoop函数，最终将执行master发送给它的任务。 Wehen在启动任何工作进程时出现错误，在执行socketConnection时，主服务器将挂起，等待工作人员连接到该工作进程，即使该工作人员可能已经死亡或者甚至从未成功创build过。
使用outfile参数非常好，因为它经常会显示导致工作进程死亡的错误，从而导致主机挂起。 但是，如果没有揭示什么，那么去手动模式。 在手动模式下，主机打印命令以启动每个工人，而不是执行命令本身。 这是更多的工作，但它可以让你完全控制，甚至可以根据需要debugging工人。
这是一个例子：
> library(parallel) > cl <- makePSOCKcluster(1, manual=TRUE, outfile='log.txt') Manually start worker on localhost with '/usr/lib/R/bin/Rscript' -e 'parallel:::.slaveRSOCK()' MASTER=localhost PORT=10187 OUT=log.txt TIMEOUT=2592000 METHODS=TRUE XDR=TRUE
接下来打开一个新的terminal窗口（命令提示符，或其他），并粘贴在该Rscript命令。 一旦你执行了它，makePSOCKcluster应该返回，因为我们只请求一个worker。 当然，如果出现问题，就不会返回，但如果运气好的话，terminal窗口会显示一条错误消息，您将得到一条重要线索，希望能够解决您的问题。 如果你不那么幸运，Rscript命令也会挂起，你将不得不深入下潜。
要debugging工作人员，您不需要执行显示的Rscript命令，因为您需要交互式会话。 相反，您使用以下命令启动R会话：
$ R –vanilla –args MASTER = localhost PORT = 10187 OUT = log.txt TIMEOUT = 2592000 METHODS = TRUE XDR = TRUE
在那个R会话中，你可以在.slaveRSOCK函数上放一个断点，然后执行它：
> debug(parallel:::.slaveRSOCK) > parallel:::.slaveRSOCK()
现在，您可以开始逐步完成代码，可能会在slaveLoop和makeSOCKmaster函数上设置断点。
