安装devtools软件包的问题
我希望使用devtools
包。 我已经运行了以下命令:
> install.packages("devtools", dependencies = TRUE) .... > library(devtools) Error in library(devtools) : there is no package called 'devtools'
我究竟做错了什么?
编辑:这是重新启动会话后重新运行install.packages
命令的结果。
> install.packages("devtools", dependencies = TRUE) Installing package into '/home/evanaad/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0' (as 'lib' is unspecified) --- Please select a CRAN mirror for use in this session --- Warning: dependencies 'roxygen2', 'BiocInstaller', 'rstudio' are not available also installing the dependencies 'httr', 'RCurl' trying URL 'http://cran.at.r-project.org/src/contrib/httr_0.2.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 50183 bytes (49 Kb) opened URL ================================================== downloaded 49 Kb trying URL 'http://cran.at.r-project.org/src/contrib/RCurl_1.95-4.1.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 870915 bytes (850 Kb) opened URL ================================================== downloaded 850 Kb trying URL 'http://cran.at.r-project.org/src/contrib/devtools_1.4.1.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 105214 bytes (102 Kb) opened URL ================================================== downloaded 102 Kb * installing *source* package 'RCurl' ... ** package 'RCurl' successfully unpacked and MD5 sums checked checking for curl-config... no Cannot find curl-config ERROR: configuration failed for package 'RCurl' * removing '/home/evanaad/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/RCurl' ERROR: dependency 'RCurl' is not available for package 'httr' * removing '/home/evanaad/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/httr' ERROR: dependencies 'httr', 'RCurl' are not available for package 'devtools' * removing '/home/evanaad/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/devtools' The downloaded source packages are in '/tmp/RtmptvmTrA/downloaded_packages' Warning messages: 1: In install.packages("devtools", dependencies = TRUE) : installation of package 'RCurl' had non-zero exit status 2: In install.packages("devtools", dependencies = TRUE) : installation of package 'httr' had non-zero exit status 3: In install.packages("devtools", dependencies = TRUE) : installation of package 'devtools' had non-zero exit status
根据damienfrancois的build议,我安装了libcurl4-gnutls-dev,问题解决了。
编辑(@dardisco)
在你的shell中:
apt-get -y build-dep libcurl4-gnutls-dev apt-get -y install libcurl4-gnutls-dev
如果您使用的是Ubuntu / Linux:
sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev libssl-dev
如果你正在使用CentOS:
尝试:
sudo yum -y install libcurl libcurl-devel
对于我的Debian Jessie盒子,我还包括:
sudo apt-get build-dep libxml2-dev
提示: r-tool控制台输出非常详细,所以我会检查其他的依赖关系。
然后,我终于明白了:
> find_rtools() [1] TRUE
现在(Ubuntu 14.04)我需要两个:
$ sudo apt-get -y install libcurl4-gnutls-dev $ sudo apt-get -y install libssl-dev
对于ubuntu用户,在terminal上运行这个命令[在UBUNTU 16.04中testing]
sudo apt-get -y install libcurl4-openssl-dev
按照您通常在R中使用的方式发布此安装库
install.packages("package name")
解决这个问题的最佳scheme 我正在寻找同样的问题。 我花了一天,然后我得到解决scheme。 现在,这很好。
如果你在Ubuntu或Linux上,请在bashterminal上检查你的R版本。
R --version
然后使用这些命令
sudo apt-get update sudo apt-get upgrade
现在检查R.的新版本。使用这个命令
sudo apt-cache showpkg r-base
现在只更新R。
sudo apt-get install r-base
现在R将被更新,错误将被删除。 确保在要安装新软件包的位置cd
库path。 这种方式在bashterminal。 尝试在主文件夹中创buildR目录,否则它将处于默认状态。 findpackage〜/ R / lib /的位置。
R .libPaths("~/R/lib") install.packages("devtools")
要么
install.packages("devtools", lib="~/R/lib")
CentOS 7:我已经安装了libcurl和gnutls开发包,但是在R中安装devtools的时候还是得到了“无法加载git2r.so”的错误。我不得不“重新安装”它们才能正常工作:
sudo yum reinstall gnutls-devel.x86_64