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任何使散点图中的绘图点在R中更透明的方法？: 我有一个3列matrix; 根据第1列和第2列值绘制点图，但是根据第2列（6个不同组）绘制颜色。我可以成功地绘制所有的点，但是最后一个被分配了紫色的绘图组（组6）掩盖了其他组的绘图。有没有办法让情节点更透明？ s <- read.table("/…/parse-output.txt", sep="\t") dim(s) [1] 67124 3 x <- s[,1] y <- s[,2] z <- s[,3] cols <- cut(z, 6, labels = c("pink", "red", "yellow", "blue", "green", "purple")) plot(x, y, main= "Fragment recruitment plot – FR-HIT", ylab = "Percent identity", xlab = "Base pair position", col = as.character(cols), pch=16)

pylotly python：完全免费的？: 我对Python库的“自由”状态有些困惑，Plotly。它在自己的网站上说，它是免费的，开源的，但同时它说，如果你想在networking上发布图表，你将需要一个Plotly帐户。 https://plot.ly/python/offline/ 我想build立一个networking应用程序，利用剧情python和JavaScript库 – 我可以做到这一点，没有一个阴谋的帐户？编辑：如果你要downvote这个问题，请亲切的解释如何可以改善。

使用ggplot2（dynamic不手动）: 我正在尝试使用ggplot2来创build一个日志正常y比例的性能图表。不幸的是我不能产生好的滴答作为基地function。这里我的例子： library(ggplot2) library(scales) # fix RNG set.seed(seed=1) # simulate returns y=rnorm(999,0.02,0.2) # M$Y are the cummulative returns (like an index) M=data.frame(X=1:1000,Y=100) for (i in 2:1000) M[i,"Y"]=M[i-1,"Y"]*(1+y[i-1]) ggplot(M,aes(x=X,y=Y))+geom_line()+scale_y_continuous(trans=log_trans()) 产生丑陋的蜱：我也试过： ggplot(M,aes(x=X,y=Y)) + geom_line() + scale_y_continuous(trans=log_trans(), breaks=pretty_breaks()) 我如何获得与默认绘图函数相同的中断/滴答： plot(M,type="l",log="y") 结果应该看起来像这样，但不是硬打字，而是dynamic的。我尝试了像axisTicks()函数，但没有成功： ggplot(M,aes(x=X,y=Y)) + geom_line() + scale_y_continuous(trans=log_trans(), breaks=c(1,10,100,10000)) 谢谢！编辑：插入图片

制作一个圆形的中心（又名赛道图）: 我被要求重新创build以下风格的情节。（请忽略这是否是一种很好的可视化types的问题，并且可以认为这是为数字表添加一个彩色元素。其中大部分是相当简单的，但我还没有find一个好的方法，使中心空心。为了时间的利益，我可以诉诸添加隐形的虚拟数据（我会张贴这种方法，如果没有其他人做，但似乎不如最好的修改主题）。有没有基于主题的解决scheme或非ggplot2 R解决scheme？我们在模仿什么简单的ggplot2结果（不需要的填充中心） library(ggplot2) # make sample dataframe Category <- c("Electronics", "Appliances", "Books", "Music", "Clothing", "Cars", "Food/Beverages", "Personal Hygiene", "Personal Health/OTC", "Hair Care") Percent <- c(81, 77, 70, 69, 69, 68, 62, 62, 61, 60) internetImportance<-data.frame(Category,Percent) # append number to category name internetImportance$Category <- paste0(internetImportance$Category," – ",internetImportance$Percent,"%") # set factor […]

Streamgraphs在R？: R中有没有Streamgraphs的实现？ Streamgraphs是堆叠图的一个变体，对Havre等人的ThemeRiver进行了基线select，图层sorting和颜色select的改进。例：参考： http : //www.leebyron.com/else/streamgraph/

如何在R中绘制函数曲线: 绘制一个简单的曲线的function是什么样的 eq = function(x){x*x} 在R？这听起来很明显的问题，但我只能在stackoverflow上find这些相关的问题，但它们都更具体在R中绘制线function 在R中的数据点之上绘制函数我怎样才能绘制复杂的数字R函数？如何绘制一个简单的分段线性函数？在同一个绘图中绘制多个函数曲线我希望我没有写一个重复的问题。

Python绘图库: Python中有哪些替代方法可以用于绘图？特别是，我正在寻找一些不使用pylab有状态模型的东西。

用xyz坐标绘制三维表面图: 我希望有经验的人可以帮助如何从xyz数据准备形状文件。一个精心准备的数据集的一个很好的例子可以在这里看到彗星Churyumov-Gerasimenko，虽然没有提供创build形状文件的前面的步骤。我试图更好地理解如何将一个曲面应用到给定的一组XYZ坐标。使用笛卡尔坐标直接与R包“rgl”，但形状环绕似乎更困难。我find了R程序包geometry ，它提供了一个QHULL函数的接口。我试图用这个来计算Delaunay三angular面，然后我可以在rgl中rgl 。我无法找出与函数delaunayn相关的一些选项，可能控制这些方面计算的最大距离。我希望这里的某个人可能会对xyz数据的表面build设有所改进。使用“斯坦福兔子”数据集的示例： library(onion) library(rgl) library(geometry) data(bunny) #XYZ point plot open3d() points3d(bunny, col=8, size=0.1) #rgl.snapshot("3d_bunny_points.png") #Facets following Delaunay triangulation tc.bunny <- delaunayn(bunny) open3d() tetramesh(tc.bunny, bunny, alpha=0.25, col=8) #rgl.snapshot("3d_bunny_facets.png") 这个答案让我相信Qhu的R实现可能会有问题。另外，我现在已经尝试了各种设置（例如delaunayn(bunny, options="Qt") ），效果不大。在这里列出了 Qhull选项编辑：这是一个额外的（更简单的）球体的例子。即使在这里，面的计算并不总是find最近的相邻顶点（如果你旋转球，你会看到一些穿过内部的方面）。 library(rgl) library(geometry) set.seed(1) n <- 10 rho <- 1 theta […]

Matplotlib传奇不工作: 自升级matplotlib以来，每当尝试创build图例时都会收到以下错误消息： /usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/legend.py:610: UserWarning: Legend does not support [<matplotlib.lines.Line2D object at 0x3a30810>] Use proxy artist instead. http://matplotlib.sourceforge.net/users/legend_guide.html#using-proxy-artist warnings.warn("Legend does not support %s\nUse proxy artist instead.\n\nhttp://matplotlib.sourceforge.net/users/legend_guide.html#using-proxy-artist\n" % (str(orig_handle),)) /usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/legend.py:610: UserWarning: Legend does not support [<matplotlib.lines.Line2D object at 0x3a30990>] Use proxy artist instead. http://matplotlib.sourceforge.net/users/legend_guide.html#using-proxy-artist warnings.warn("Legend does not support %s\nUse proxy artist instead.\n\nhttp://matplotlib.sourceforge.net/users/legend_guide.html#using-proxy-artist\n" % (str(orig_handle),)) 这甚至发生这样一个简单的脚本： import matplotlib.pyplot as […]

将文本放在matplotlib图的左上angular: 我怎样才能把文本放在matplotlibgraphics的左上angular（或右上angular），例如左上angular的图例是左上angular，还是左上angular？例如，如果它是一个plt.scatter（），那么将在散点图的正方形内的东西放在最左上angular。我想这样做，而没有理想地知道被绘制的散点图的比例，因为它将从数据集变成数据集。我只是希望它的文字大致在左上方，或大致在右上方。使用图例types定位，它不应该与任何散点图点重叠。谢谢！