如何使用AWK合并两个文件?
文件1有5个字段ABCDE,字段A是一个整数值
文件2有3个字段AFG
文件1中的行数比文件2(20 ^ 6至5000)大很多,
文件1中A的所有条目出现在文件2中的字段A中
我喜欢把字段A中的两个文件合并,并携带F和G.
期望的输出是ABCDEFG
例
文件1
ABCDE 4050 S00001 31228 3286 0 4050 S00012 31227 4251 0 4049 S00001 28342 3021 1 4048 S00001 46578 4210 0 4048 S00113 31221 4250 0 4047 S00122 31225 4249 0 4046 S00344 31322 4000 1
文件2
AFG 4050 12.1 23.6 4049 14.4 47.8 4048 23.2 43.9 4047 45.5 21.6
期望的输出
ABCDEFG 4050 S00001 31228 3286 0 12.1 23.6 4050 S00012 31227 4251 0 12.1 23.6 4049 S00001 28342 3021 1 14.4 47.8 4048 S00001 46578 4210 0 23.2 43.9 4048 S00113 31221 4250 0 23.2 43.9 4047 S00122 31225 4249 0 45.5 21.6
$ awk 'FNR==NR{a[$1]=$2 FS $3;next}{ print $0, a[$1]}' file2 file1 4050 S00001 31228 3286 0 12.1 23.6 4050 S00012 31227 4251 0 12.1 23.6 4049 S00001 28342 3021 1 14.4 47.8 4048 S00001 46578 4210 0 23.2 43.9 4048 S00113 31221 4250 0 23.2 43.9 4047 S00122 31225 4249 0 45.5 21.6 4046 S00344 31322 4000 1
谢天谢地,你根本不需要写这个。 Unix有一个连接命令来为你做这个。
join -1 1 -2 1 File1 File2
这里是“行动中”:
will-hartungs-computer:tmp will$ cat f1 4050 S00001 31228 3286 0 4050 S00012 31227 4251 0 4049 S00001 28342 3021 1 4048 S00001 46578 4210 0 4048 S00113 31221 4250 0 4047 S00122 31225 4249 0 4046 S00344 31322 4000 1 will-hartungs-computer:tmp will$ cat f2 4050 12.1 23.6 4049 14.4 47.8 4048 23.2 43.9 4047 45.5 21.6 will-hartungs-computer:tmp will$ join -1 1 -2 1 f1 f2 4050 S00001 31228 3286 0 12.1 23.6 4050 S00012 31227 4251 0 12.1 23.6 4049 S00001 28342 3021 1 14.4 47.8 4048 S00001 46578 4210 0 23.2 43.9 4048 S00113 31221 4250 0 23.2 43.9 4047 S00122 31225 4249 0 45.5 21.6 will-hartungs-computer:tmp will$
您需要将文件2中的条目读入BEGIN块中的一对关联数组。 假设GNU Awk:
BEGIN { while (getline < "File 2") { f[$1] = $2; g[$1] = $3 } }
在主处理块中,读取文件1中的行,并使用BEGIN块中创build的数组的正确数据打印:
{ print $0, f[$1], g[$1] }
提供文件1作为程序的文件名参数。
awk 'BEGIN { while (getline < "File 2") { f[$1] = $2; g[$1] = $3 } } print $0, f[$1], g[$1] }' "File 1"
文件名参数周围的引号是需要的,因为文件名中有空格。 即使不包含空格,也需要围绕getline
文件名引用引号,否则将是variables名称。
awk 'BEGIN{OFS=","} FNR==NR {F[$1]=$2;G[$1]=$3;next} {print $1,$2,$3,$4,$5,F[$1],G[$1]}' file2.txt file1.txt